mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGTGTGGATGCGGCATGGG CATGCCCAGACCACGCTCCAG CGTGGCAGGGGTCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCCCCTGCCCCG 3 2 5' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR1142 4e-40 -56.3 ((.(((((((((...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...))))))))).)) (-56.30)