mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTAGTCATCCCAAGGCGT GCCTTGTGACGACTAAGTTA TGTAATGCGGGAAAATGGTAACTTAGTCATCCCAAGGCGTGTATCACCCATGTTACGGGCGACCTGTAACACGGGTGATACACGCCTTGTGACGACTAAGTTACCATTTTCCCTCGTTACA 2 0 5' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR1154 2e-64 -90.6 .((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((.(((((((((...))))))))).))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))).)))))). (-90.60)