mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTCCTGCACGAGGAAGGAGC TCGTTCCTCAAGCAGGACTCAA TGAGGCTCGTTCCTCAAGCAGGACTCAAAGAACCCGATCAGCTTGTCGAGCACGACAAGGTGATCGTGTTTTCTTAGTCCTGCACGAGGAAGGAGCCCCA 4 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR1155 5e-52 -60.8 .(.(((((.((((((..((((((((.(.(((((.((((((.(((((((....))))))).)))))).))))).).))))))))..)))))).))))).). (-60.80)