mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGGTGTGATGATTTGAAAC ATCATGCATCGTTACACCCCCC GAGCATCATGCATCGTTACACCCCCCACCGTGCACCTTCACGCTCATGCGCAGCACTGTGCATGCTTGGGGTGTGATGATTTGAAACTT 3 2 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii pmrd 100 cre-MIR1167 2e-45 -36.6 (((..(((...(((((((((((((....((((......))))..((((((((....))))))))...))))))))))))).)))..))) (-36.60)