mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACCCTCTATCTGTCATC GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGGGTACTTTCTTGCATGCTTGAGCCTTTCATGCTTGAAGCTCTGCGTGCTCACCCTCTATCTGTCATCCACTTTTCTCTCTCTCTCTC 1 1 5' arm Gossypium_hirsutum pmrd mir-156 1e-16 ghr-MIR156b 2e-51 -49.7 (((((((((((((.((((((((.((((((...(((..(((((...........)))))..))))))))).)))))))).)))).))))))))).................... (-49.70)