mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACCCTCTATCTGTCATC GGTGTCAGAAGAGAGTGAGCACACAGGGTTCTTTGTAGCATGCTTGAGCCTTTCATGCTAGAAGCTATGTGTGCTCACCCTCTATCTGTCATCCACT 2 1 5' arm Gossypium_hirsutum pmrd mir-156 0.000000001 ghr-MIR156c 3e-50 -45.4 ((((.((((((((.(((((((((((.(((...((.(((((((...........))))))).))))).))))))))))).)))).)))).)))).... (-45.40)