mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCCATCCTGAGTTTCA TGGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGATCCATCTTTCAAGCTTTCATGCATGTATGTTATTTGATCCTCATATAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATCGGTTCTTCTT 2 0 5' arm Gossypium_hirsutum pmrd MIR390 0.000000000000002 ghr-MIR390b 3e-66 -52.5 .(((((((((.((.((((((((((.(((((((((.(((((.((((...(...((.((......)).))...)......)))).)).))).))))))))).)))))))))).)).))))))))). (-52.50)