mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCCATCCTGAGTTTCA GTATGGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGATCCATCTTTCAAGCTTTCATGCATGTATGTTATTTGATCCTCATATAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATCGGTTCTTCTTGCTTG 2 0 5' arm Gossypium_hirsutum pmrd MIR390 0.000000000000002 ghr-MIR390b 6e-71 -54.2 (((.(((((((((.((.((((((((((.(((((((((.(((((.((((...(...((.((......)).))...)......)))).)).))).))))))))).)))))))))).)).))))))))))))... (-54.20)