mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCACAGGCTTTCTTGAACGG GTTGTGAAGTGTTTGTGATTT ATGTTGTGAAGTGTTTGTGATTTGTGATCATTGTTGTTGATGTTGATATTGGAGTGGTTTGGCAATTCCACAGGCTTTCTTGAACGG 5 2 3' arm Gossypium_hirsutum pmrd 100 osa-MIR396g 0.000004 -18.3 .((((..((((.(((((((..(((((((((((.(((((......))))..).)))))))..))))...)))))))))))...)))). (-18.30)