mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTACTCCTCCCATACC AGTGGGATGGGTGGAA GGAAGTGGGATGGGTGGAAAGATTTGTATTTTCTCTCTTGAGTTTCTAAGAATGTAAAGCAAATCTTTCCTACTCCTCCCATACC 4 1 3' arm Gossypium_hirsutum pmrd 100 ghr-MIR482a 4e-43 -33.5 ....((((((.((((((((((((((((.(((.(..(((((......)))))..).))))))))))))))).)))).))))))... (-33.50)