mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG ACGGAAGCTTTGTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACCCTTCTTCATCTTGATCTTGTGTAGACTACTATGCTTGTGGTCAAGGAATACATAGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATATGCTTCCAAA 4 0 3' arm Glycine_max pmrd mir-166 0.000000000009 gma-MIR166a 3e-79 -62.12 ..((((((..(((...(((.((((((((..((((((..(((.(((.((......((((((((..((((((....))))))....)))))))).......)).))).)))..))))))..)))))))).)))..))).))))))... (-62.12)