mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG GCTTGCAAAGGTGAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGGAGGAGGAGGAGGAGTAGAGTACTGAGATCAGTGAAAGTTTCCAATGGAAATTTACCCTCTTACACAAAAAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCACCCAACTTTTGCTTTT 5 0 3' arm Glycine_max pmrd mir-166 0.00000000000004 gma-MIR166b 3e-79 -63.77 ....((((((((..(((.(.(.((((((..((((((..(((((((((........((((((.((((..(((((....)))))...((((((...))))))))))))))))..........)))).)))))..))))))..)))))).)).)))..)))))))).... (-63.77)