mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCT GGAATGCAGTGTGGTCCAAGG GGGGAATGCAGTGTGGTCCAAGGAGATGATATATCACTTCACCATACTCATATCTTCACAAACTCATCAGATTCAGATGTAATAATAATTTGTAATATATGCATATTATGTCTCCTCGGACCAGGCTTCATTCCCT 3 0 3' arm Glycine_max pmrd mir-166 0.000008 rco-MIR166a 0.0000004 -45 ((((((((.(((.((((((.(((((((.....................................((((.......)))).....(((((.((((.....)))).)))))))))))).)))))).))).)))))))) (-45.00)