mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTGTTTGGCTATG AAGAGGAAGAGAGAGTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGTTATTATTTGCTCATGTTCATGCTCACCGGTTTCCTTGCCGGCAAGTTGTGTTTGGCTATGTTTTGCTCTCTTCTTCT 4 0 5' arm Glycine_max pmrd MIR169_2 0.000002 gma-MIR169a 2e-64 -57.2 .((((((((((((...(((..(((((((.(..(((((((((((.....(((((..(((....)))..))..))).....)))))))))))..).)))))))..)))...)))))))))))) (-57.20)