mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGGCCTTGGCTA CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCATTAGCCAAGTGAATGAGCATCATATATATATATATATATATATATATATATATGACTCATGTTCTTGTCGGCAAGTTGGCCTTGGCTA 3 0 5' arm Glycine_max pmrd MIR169_2 0.0000004 zma-MIR169p 0.0000003 -56.41 .((((((((..((((((((((((..(((.......(((((..((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))..))))))))))))..)))))))). (-56.41)