mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTATTGCTTAAAATGAAAT TTAATTTTAAAGAATAATTA TACAGACAAATTTATTGCTTAAAATGAAATTAACCAACTTTCTTAAAATGCATAAAATAGTTAATGTTTTATAATTAGTATGATTACCCGTGTAATGTAACATTGTGATTTTTCTAATTCATGATAAAGTGATTGAAAATAATTATAAGAGTTAGTTTAATTTAATTTTAAAGAATAATTAATAAATA 4 0 5' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1522 2e-65 -27 ...........(((((..(((((((.((((((((.((((((..(((.....((((((((.....)))))))).(((((...((((((..((((......)))).))))))...)))))((((......))))..........)))..)))))).).))))))).)))))))..))))).......... (-27.00)