mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGAGTCCGAGGAAGGAACTCC AGTTCATTCTTCGCACTCTCTCGGA GCGACTTATTGGAGTTCATTCTTCGCACTCTCTCGGAAACCACTTGTTTCCAATCATCTAATCAGACGATAGCAGACTCAAGAAAGACGTTTCCTTCCCAGATCCTTCTAGACCATTTGCAAACCGTCTCCTTCCCCGAATCCATTCTCCAAACCCTCGATCCTTGAGGAGCTCCACCACCGTGACGGCGCTCCGGTCTCCGCCGTCAATTGTGCCGTCGCGGTGGAGCATGAGCGTCTTCATGAGTCTGAAAGGGAATTATAGGAACTACTTTCCTGATTAGGTTATTGGAAACAAGTGGTTTCCGAGTCCGAGGAAGGAACTCCAACGCCCAAC 3 4 3' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1524 0 -145.6 (((.....(((((((((.(((((((......(((((((((((((((((((((((.((((((((.........((((((((.(((.(((((((.((((...((((.....((((............))))........(((....)))...........))))...)))).((((((((...((((((((((..((((....))))......))))))))))))))))))..)))))))))).))))))))...(((((...(((...)))..))))))))))))).)))))))))))))))))))))))..))))))).))))))))))))..... (-145.60)