mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGGAAGAGGAAAATTAAGCAA TTTTATTTTTCTTCTTCCGGAT AACAAAAATTTTATTTTTCTTCTTCCGGATCAAGTTGATCCGGATCTTCCGGATCAACTTGATCCGTAAGAGACTTCCGGATTAAGTTGATCCAGAAGTTACGGATCAAGTTAATCCAGAAGAGACTTTCGGATCAACTGATCCGGAAGAGGAAAATTAAGCAAGGATAATTTT 4 0 3' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1526 7e-96 -89.1 .........((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((.(((((((((((((....(((((.(((((.....))))).)))))))))))))))))).)))).)))))....))))))))))))))))))))))))))))).))))............. (-89.10)