mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAAGGAAACAATTAATCGTTA ATCATTAATTGTCTACCTTCACTATTTTATTAAACGTTTATC AATTAGATGTTAATCATTAATTGTCTACCTTCACTATTTTATTAAACGTTTATCGTTACATGTCACGATTTTATTAAACATTAATTTTATGTACCTAATTAACGTTAACTTCCAATAAAATTAGGATGCGTGATAATCAACATTTAATAAAAGTACGACACTTAACGATTAAAGGAAACAATTAATCGTTAACGTTCAATT 5 19 3' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1529 6e-112 -44.92 ((((..((((((((.(((((((((...((((....................(((((((..((((....((((((((((..((.(((((((((((((((((..................))))))).))))))).))).))..))))))))))....))))..)))))))..))))..))))))))).))))))))..)))) (-44.92)