mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTCACATAAATTAAAATAT ATAAGTTTTATGTGAAAATA GCAAAATATAATATTAATATAAGTTTTATGTGAAAATAATTTAATTTTTTTTAATTTATTATATTTTTATAATTTTATATATTATCTTTTAAAATATAATATATAAGATTAAATTCTATTTTCACATAAATTAAAATATGTATGTTTAT 4 1 3' arm Glycine_max pmrd 100 100 -27.2 ...(((((((......((((....((((((((((((((..((((......))))...............((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))).....)))))))))))))).....)))).))))))).. (-27.20)