mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTCCATATGGGAAGACTTGTC AAGTCTTCCCATATGGACGAAGAGATAGGTAAATGTTGAAGTAGGCCTGTGGGTTTCTTGGCTTCAACCTTTACCAATCCCTTCGTCCATATGGGAAGACTTGTCTCTCGACTTC 0 110 3' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1531 7e-61 -65.3 ((((((((((((((((((((((.(((.((((((.(((((((((((((....)))))....)))))))).)))))).))).))))))))))))))))))))))(((....)))... (-65.30)