mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTTTGGGTAAATAGTCAT GATTATTTACCCTTTAAAATAAG GATTAAATTATATTTTGGGTAAATAGTCATTTTCATCCCTGAATGTGTAGAGCGCTAACAAATTCGTCCTTAAATGTGTCACATAGGCTTTTTCATTAACGGTAACAAATGGACAGATTTGTCGCATTTTTTTCACTTTTAGAGACTAAAATTTGAATTTTTATCTTTCGGAGACGAATTTATTAGTGCTCTGCACATTCAAGGACAAAAATGATTATTTACCCTTTAAAATAAGTTTGGCAT 0 3 5' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1534 2e-124 -86 (.(((((((.(((((((((((((((((((((((..(((.(((((((((((((((((((.(((((((((..(((((.((((.(((..(((.((.....)).))).....))))))).)))))...............((..(((((..(((((....)))))..)))))..))))))))))).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))))))))...)))))))))))))).. (-86.00)