mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGTTTGTGGTGATGTCT ACATCACCACAAACAAGTC TAAGAGGCCTAGACATCACCACAAACAAGTCACCAAAGAAGGAAGAGTGTCACAGAATCCGGGTGATCTTGTTTGTGGTGATGTCTAGACCTTCCT 0 0 3' arm Glycine_max pmrd 100 gma-MIR1535 1e-49 -50.04 ...((((.((((((((((((((((((((((((((......(((..............))).))))).))))))))))))))))))))).))))... (-50.04)