mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTTTATGCTTCTGTCATCA GTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTGCAATTAGGAGTCTTGAAGCAATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTTTATGCTTCTGTCATCACC 1 1 5' arm Gossypium_raimondii pmrd 100 gra-MIR157a 1e-52 -44.8 ..((.(((((((((((((((((((((((.(((((..((((.(((((...))))).....))))..))).)).)))))))))))))).))))))))).)).. (-44.80)