mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATGCTTCTGTCATCA GTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTTGCCTATGTGCATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCATC 1 1 5' arm Gossypium_raimondii pmrd 100 gra-MIR157b 1e-46 -44.5 ..((.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((......))).)))..))).)).)))))))))))))).))))))))).)).. (-44.50)