mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGAGAGAGAGCAC GCTCCGCTTCTTCCCATCAA TTGACAGAAGAGAGAGAGCACGGTATGCTTTTGCGTTGGAACATGCATACGAAAGTAACTAATCATACGATAAATTATCAAAACTACTGTCGATAGAGTAATTAGGAAAACAAACCTTGATGAAAAACACCGGCTGTGTGCTGGGAATTGCGTGTGGTTTCCCAAATAGAGTTCAAAGCAGGTTCGGGTTGAACCAGTTCAGGAACATTGTTAGACACAAAACTTATTTGATGTTGCCCATCATAAAATGATGAAGACTGACTTCTTGAGTTAAAGTGGACAGTTTCTTTTTCTTTTTGTGGCTTTCGGCGACGGGCATTGTGGTCAGAAAGCCTCTGGCGACAGCTCCGCTTCTTCCCATCAA 6 3 5' arm Helianthus_annuus pmrd 100 far-MIR529 0.0003 -97.3 .(((..((((((.(.((((..((((.(.(((((.(((..((((....(((....)))...(((((((((.....((((((..(((.(((....))))))....(((........)))))))))......(((((.....)))))......)))))))))...........((((..(((.(((((.....))))).)))...))))..)))).))).)))))).))))...(((((((....((((((.((.((((((((.((.(((......))).)).)))..))))).)).))))))((((((((((.(((.....))).))).)))))))...))))))))))))..))))))...))). (-97.30)