mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTC GGGATGTTGGCTGGCTCGATG GGGGATGTTGGCTGGCTCGATGCACTTACTTATCATCTTCCTCAAAAACATGCGACATATACATACATATGGAAGATCATATATCTATAAATATATATTTGTCTTCCATATCCCATATATATATGTTGATGATGGTGGAGTGATGGCATCGGACCAGGCTTCATTCCTC 6 0 3' arm Ipomoea_nil pmrd 100 aqc-MIR166d 0.00003 -63.03 (((((((..(.((((..((((((..((((((((((((...............(((((((((.(((.(((((((((((.((((((........))))))..)))))))))))....))).)))))))))..)))))).))))))..))))))..)))).)..))))))). (-63.03)