mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA ATGCTCTTTTACTCCTTGGT TTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCATGCTCTTTTACTCCTTGGTGTTTGGCCTACTGGTTTGGTGGGCCACTGTTGATCTGCTGTAGACCAGATCAACGGCTAGGATTCCTGCAAATCAGCATCCTCTTTTTATTGGAAATAAAACTGATGTTGTCATGAAATTCTTTGTAAGCATGCTCCACCCTTGTTCTTCAGTTGTATTCAGTGTGTGGCCCATCCACCATGAGGCCTGCTCGATGAACTGCTTCGATTCGCAGATGTTCTTTTGGAAGATTTTACTGTTCTTTACTTTAATTTTAATGAGCGTTAACGGGTGGATCTCCCCTTGCAGGAAATTGATATC 9 1 5' arm Liriodendron_tulipifera pmrd MIR159 0.00002 vvi-MIR159c 0.000001 -101.03 ...(((...((((((((..........))))))))..)))..((((((.((((((((.....)))))))).(((((((((((........)))))))))))......(((((((((..(((((((....((((((.....))))))..)))))))........................(((((((....(((((.......((((.((.(((((((((.....))).)))).)).)).))))((((........))))...........)))))..(((.(((((.................))))).))).))))))).......)))))))))...)))))) (-101.03)