mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGG TTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTTTTATTCGATCTTTTGATTTTTGTGTTTATATTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTAA ACTCTTTTCTTCCTCCTTTTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAAGAAAAAAATAAAAATAAAATCGAGTGTTAGGGTTTTTTTTGCCATGAGAGATCTATTAGTTTCAAGGTCTTTGTGGGTGACGAGTTTGTTTTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTTTTATTCGATCTTTTGATTTTTGTGTTTATATTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTAATTCTATCCCCTCGAACAAGAACAATTACAAAACAATACAATACCACAAGGTTTGTGTTTGTTTTTTTTTGTTTTAAATTTTGCGTACATATATAATTTTTGTTATTTCTATTTTTGGTAAATGGATTTTATGAGCAGATAATGTTGTGTCTGTGTGTGTGTGGGAAGTGAATTTATTAAACATGGGGTGCTGCAGATTGGTATAATGATGAAGCTTTTTGACTTAACCTAGCCTTTTCTGTGGTTCAAAAGCTTTTCTTCATCATGATTGGTTCTTTCTTCTAATCTTAGATCCTGTAATGATTTCATTTTTTTCCCCTTCATCATCAGCTCATTATCTTGTTTCTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTAATTTTTCTCTTGTTGATCTTCTTTAATTTTTTCACTTCCCCTTTTTTGTGCCTATTTTAGATCTATTCTTCTTCTTGTTCTTCTAATAAACTTTTGAATAATTTTCTCTCTCTTCTTGCATGTCTTGGTGTTGGTGAGTTGATTAGATCAATCAAGTAAAAAAGTTGATGGGACTTTAATTTCAATTCAATAACAAATAATGGATGATTAAGTTGTGGGGTTTCTTTTCTTTTAAAACATATAT 3 0 3' arm Cucumis_melo_subsp._melo mirnest mir-166 0.000000000002 csi-MIR166e 0.00000000000002 -38 .((..(((.((((((((..((((((.((((.((((((..(((.((...............))...)))...)))))).)))).))))))..)))))))).))).)). (-38)