mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGAGAGAGAGCAC GCAGTGGATTGATTATCCCATCCTCGATCAG TTGACAGAAGAGAGAGAGCACCATTGGAATCTGAGACTCCAGAGAAGCAGTTTCCGGAAGGAATAATACCAGGACCAGAATAATTGGCACCCCTAGCAACTGAACCTTGCAGAACAAGGTCGGATGTCGGATTTTCAGAACTGTTCAGCCAATGACTTTGGAGAAGCTTCCCTGACGCAGTGGATTGATTATCCCATCCTCGATCAG 14 19 5' arm Nicotiana_benthamiana pmrd 100 far-MIR529 0.0002 -56.6 .........((..(((.((....(((((.((...)).))))).(((((...((((....))))...........(((((...((((((....(..(((.((((.(((((.....))))))))).)))..).......((.....)).))))))...)))))....)))))......)).(.((((.....)))))...)))..)).. (-56.60)