mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTGCTCTGTCTGTCATC GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGGAACGGCACCGGCGGATGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTGTCTGTCATC 0 2 5' arm Oryza_sativa pmrd mir-156 1e-43 osa-MIR156i 4e-46 -60.7 ((((((((((((((((((((((.((((((.(....(((((((........)))))))).)))))).))))))))).)))).))))))))) (-60.70)