mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCAAGGAGCCAAGCATG GTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGACCAACCCATGGTGTCTGGTTGCCTACTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGC 2 0 5' arm Oryza_sativa pmrd mir-160 1e-43 osa-MIR160a 7e-45 -49.1 ((((((.(((((((.((((((((((.((.((((..(((((..........))))).)))))).)))))))))).))))))).)))))) (-49.10)