mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCAAGGAGCCAAGCA TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATGTAGCCCAATCCATGGTGTGTTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCA 3 0 5' arm Oryza_sativa pmrd mir-160 4e-40 osa-MIR160b 2e-41 -47.6 .((.(((((((.((((((((((((((..(((...(((((.........)))))))))))))))))))))).))))))).)). (-47.60)