mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGTACGTGCA CACGTGCTCCCCTTCTCCACC AGGTTCTTGTTGGAGAAGCAGGGTACGTGCAAAATGCACACCGGTTGGTCGAGCTAATTAACAAGCTCTGACGACCATGGTGATCGAATGCACGTGCTCCCCTTCTCCACCATGGCCTT 2 0 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR164 5e-62 osa-MIR164c 3e-63 -55.32 (((((..((.((((((((..(((((((((((.......(((((((((.(((((((........))))).)))))))..))))......)))))))))))..)))))))).)).))))). (-55.32)