mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCT GGTTTGTTGTCTGGTTCAAGG CTCTGCTTTGGTGGTTGGCTGATGTTCTCGGTTAAGGGGTTTGTTGTCTGGTTCAAGGCCTCCTGCTGTCCTACATCACATTTTTTTTTCTTTGTTCTGAATTTCTGATGGATGTGTGTGTGCATGATGCATGGCTGGTGGTGACCTCGGACCAGGCTTCATTCCCTTTAACCAGCATTTGCGTTAATACCATCAGGCAT 5 0 3' arm Oryza_sativa pmrd mir-166 2e-59 osa-MIR166m 3e-95 -76.7 ...(((((.((((((..((.((((((...((((((((((..((..(((((((((.(((((.((.(((....((((((.((((.....(((........))).....))))))))))...((((.....))))))).)).))...))).)))))))))..))..)))))))))))))))).))......))))))))))). (-76.70)