mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGCTGTGACAGTTTCACT GTGCCCAAGAGAAAGCGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTTGCAGACAAGAAATCAGCTCAGCTCGCTGGTTTCGAACAGGAAGGCGGCTAGCTGAGGCTTCTTCTGAGTACGTGATGGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACTCCTTCCCTGTTGGGCAC 0 2 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR167_1 2e-81 osa-MIR167b 2e-89 -82.5 ((((((((.((.(((.(((((((((((((((((((((((((.((..((.((((...(((((((((.((((.((((......)))).)))).)))))).)))..))))..))..))...))))))))))))))).).)))))))))..)))..)).)))))))) (-82.50)