mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATGTTGCAGCTTCACT TGTGAGAGAATGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTGTCAGGCATGAGCCAAATCTATCCATGGTGTTGGTGGTACTGAAATTACCGCGTTTTCGAGGTTTTTCGTCGTGTCAACTTGCGAAGGGAATTACGGGTTCTTGATGAGCATTGGTGATAGGAGGTGTGGGCTTGGTTAGTAGAGGTAGAATTATGATTGTTCTTGTGAGTTTCAGTAAGAGGTGGGAGTGATTGGAATTTGGCTCCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCACC 0 1 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR167_1 2e-153 osa-MIR167e 9e-155 -100.3 .((((((((.(((((((((.(((((((((((((((.....)).((((((((((((..(((...........(((((((((((((.(.....(.((((((..(.((.(((((...(((...((((((.....)))))).....)))....))))).)).)...)))))).)......).))).((((.......)))).....))))))))))..........)))..))).))))))))).)))))))))))))))))))))).)))))))). (-100.30)