mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATGCTGTGCAGTTTCA TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGAGTGCTTATTAGGTGAGGGCAGAATTGACTGCCAAAACAAAGATCAGATCATGCTGTGCAGTTTCA 1 1 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR167_1 8e-45 osa-MIR167d 4e-46 -46 .((((((((((((((((((((((....(((.....)))...(((((......))))).........)))))))))))))).)))))))). (-46.00)