mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA CTTTGTGGTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTTGAGAGAGATTAGCATCCCTATGTGTGGATTTTGCTTGCACGAGTGTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTACAGAG 1 0 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR396 3e-60 osa-MIR396b 2e-61 -52.8 (((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))..))))...))).))))))))))).)))))))))))).))))))))) (-52.80)