mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCTATC CGATGATGAAGATGATGATG TTGGATTAAAATTTAACATCACCATCATCATCATCATCATCATCTATCATGACTGCTCAGACTCAAGAAGAGCTCCTCGCTGCTAATCTCGAACAGCAGAAAATTAATCCTGATGAGCCTGTTGTTGAAGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGAAGATGATGATGACAAGGATGATGATGAGGTTGAAG TTCGTCTATCCTTTTGTTTTGTTTTGCTATTCTCTCTATCTCTCTATCTCTCTATCTCTTTGTTTTTGGATTAAAATTTAACATCACCATCATCATCATCATCATCATCTATCATGACTGCTCAGACTCAAGAAGAGCTCCTCGCTGCTAATCTCGAACAGCAGAAAATTAATCCTGATGAGCCTGTTGTTGAAGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGAAGATGATGATGACAAGGATGATGATGAGGTTGAAGGACAAGGAGATGGCAGTGGCAGATCAAAGCAGAGCAGAAGTGAGAAAAAGAGTCGGAAAGCGATGTTGAAACTTGGAATGAAAGCCATCCCTGGAGTTAGCCGTGTGACAGTTAAAAAGAGCAAGAATATTTTATTTGTCATCTCGAAGCCAGATGTGTTTAAGAGCCCGACATCTGATACTTATGTCATCTTTGGTGAGGCAAAGATAGAGGATTTGAGCTCACAACTGCAGACACAGGCTGCTGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATTTAAGCCATGTGATTTCCAAGCCTGAAACTTCAGCTATCGCCCAGGATGATGAAGATGTAGATGAGACTGGAGTGGAGCCAAAGGATATTGAGTTAGTTATGACACAGGCAGGTGTCACAAGATCTAAGGCAGTGAAGGCACTGAAGGCTGCTGAAGGGGATATTGTTACTGCCATCATGGAGCTAACAAACTAAGAGAATGCTTTTAAGCATTCTTATTGTTAGTTGAGTTTGAGCCGTGTTTCTTAAATATTCATAGACGTATGTTTCAAGATGGGATCATGCTTATTTCGTGTTGTATCAGTAACAAAATTGATGAAACCTTTTCTGTTAGACACTGGTTCCTAGAGTTAGTCTGCTATAAAAGTGTGGTTGTCTCAGAATTGATTCACAAAAGTTGTACAGCAGTTAGCATTATCATGTTGGTGCTGCATTGTGCTCAGATGCATGGAGA 2 1 5' arm Aquilegia_formosa_x_Aquilegia_pubescens mirnest 100 100 -53.5 .....((((..((((.(((((((.(((((((((((.((((((((..((((..((((((...........))))(((((.......((((..((((((((...((((....))))....))))))))..))))...)))))...)))))).)))))))).)))))))))))...)).))))).)))).)))).. (-53.5)