mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG CCGTTGACTTTTTAGTACGTAT GAAGATAGCTTGTAATGTACTCCCTCCGTTTCAAAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTAGTACGTATTTGATCATTCGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTTATTTTTTTCATATCGTTTGATTTATTGTTAAATATACTTTCATGTACACATATAGTTTTACATATTTCATAAAATTTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTCGAAACGGATGGAGTATTTATTGTAACTTT 0 0 3' arm Oryza_sativa pmrd MIR806 2e-79 osa-MIR806c 2e-140 -119.44 ((((...((..((((.(((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((......(((.......)))........)))))))))))..(((((.((.....))..)))))........))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).))))))))))).))..)))) (-119.44)