mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATGACCATCAGCAAACA TTTGTTGCTGGTCATCTAGCT TTTTGTTGCTGGTCATCTAGCTACCCGTGCATGCCTGGAGATTGGAGAATAATTGACGATGCAGCAGTCGGCTTATTGGCTCTTGGGCACGCGTGGTTAGATGACCATCAGCAAACA 3 0 3' arm Oryza_sativa pmrd 100 osa-MIR827b 5e-62 -51.1 .(((((((.(((((((((((((((.(((((...((.((((....(((.........((((......)))).))).....)))).))))))).))))))))))))))).))))))).. (-51.10)