mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGCTTTCTTCAGTCCACTC TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT TAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCGGTAGGGTTTAATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAATATTGAGTCCAAAAATTTCAAATCTCAAATGGATTCACTAAACGATTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTT TAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCGGTAGGGTTTAATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAATATTGAGTCCAAAAATTTCAAATCTCAAATGGATTCACTAAACGATTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTCTTTCTATCTTTTCCTTTTCTTCATCCTCGAGATCGAGATCTCTATCGTATAGCTTAATTGATTAAACATATGTATTTGTTAAAAGCTTACAATACCCACTTTCTCGATTCTTCTTCTTAATCAGACGTTCAAAGACTTGCCGTCGACATAGCTCAGGTCAGAAGTGATGGAGAGCCTGGACTCAGATTTGTGCAGAGAGGACCCATTTGAAGTAAATTTCAGGTAAAAAAAGAAATGTCTTTTTTTTTTTTTAAATGTTATTAATGTTAGATGATATTAATGTGGGAAGGAAGAAGAATGTGGATTAGGGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGGAAAAAGATGGAATATTTG 4 0 5' arm Cucumis_melo_subsp._melo mirnest MIR159 4e-33 ptc-MIR319a 2e-34 -68 .(((.(((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((..((.(((..(((((((.((...((.((((((((..................)))))))).))...)).)))))))..))).))...)))))))))))).))).)))))...))))))))))))))))).))) (-68)