mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAGATGGCTCAGCAGTT AGGCCTGGGTTTTCTTTCCAGC AGAAAATGAGTTTGGGGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGTGCTAGTTGCTCTCACAGAAGGCCTGGGTTTTCTTTCCAGCACCCAAATGGTGTTGCAC ATTCGTCGACATGCAAGAAAGAATTTATTCTTAAAATCTTCCTCAACATAATGTTACTTGGAATTGATGACATTATTTACATTTAGAAAAAAAATGAAAATGTAATGTTAGAAAATGAGTTTGGGGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGTGCTAGTTGCTCTCACAGAAGGCCTGGGTTTTCTTTCCAGCACCCAAATGGTGTTGCACAACTACCTGTAACTTCAGTTTCAGGGGGATCTGATGCCTTCTGACTCCTGCCTGCAGCTCGCTGTTGTGTGCATACTTAACACTCAGGCACACA 3 1 5' arm Mus_musculus mirnest tRNA 0.00009 mmu-mir-3473 0.00008 -36.6 ....((((.(((((((...((((((((((.((((((((..((.((.((.....)).))....))..).))))))).)))))))))).)))))))..)))).... (-36.6)