mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAGGTGCAGAGGCAGATGC ATTTGCACCTGCACCTACAG GATAGAGCTGCATTTGCACCTGCACCTACAGAGAGGAAGATGAAGCAGCAAGCTAGCAATACGTGCTTGATCGCTATACGCTAGCTTCTTGCACACAATGTTGTTCCTGGTCTCTTCCTGATCCCTAGGTGCAGAGGCAGATGCAACTATGTC 3 0 3' arm Oryza_sativa pmrd MIR530 0.0000006 osa-MIR530 2e-83 -65.1 ((((.((.(((((((((..(((((((((..((.(((((((.((.((((.((((((((.(((.(((......))))))..)))))))).))))..(((....)))......)))))))))..))..)))))))))..))))))))).)).)))) (-65.10)