mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCTTCCTCGTCCTCTTCCT GTGGGGGACCAGGGGGAGGCG GTTCCGACGCTGGTGGGGGACCAGGGGGAGGCGTTGACGGGCTTCGTGGAAGAGCTGCTGAGCCCATTGGGCCTGCTCCTGCTGCCCATTGGGCTGCTCCTTGTGATCCAGTTCCTCTCCTCGGCCCAGGGCTCCGTGGTGGCCGGAATATTCTCGACCGACGAGCCCGACTCCATCCACCGGGTCAGCGGGTCTCCCGTGGGCGTCGCCCTCTTTCTCTTCCTCGTCCTCTTCCTCCTCTACAA CTTTTCCAACAAAGCGCGTCCCGTCCCAAGCACCTCTATAAGACCAAAAACCCATCTCCTCTTATTTTACTCTCCATTCAGAGAAAAGTGAAAAAACAAAACACACTCATACACTCACCTCCACAAGAAAAAAAAAATTACATAAACGCAAAGAATGATAGAAGACCAACAACGCGGAGGAGGCGCTCCGTACGGGGCGCTGCTGGTGGTGGTGGTGGTGACGATGATGGTGGTTCCGACGCTGGTGGGGGACCAGGGGGAGGCGTTGACGGGCTTCGTGGAAGAGCTGCTGAGCCCATTGGGCCTGCTCCTGCTGCCCATTGGGCTGCTCCTTGTGATCCAGTTCCTCTCCTCGGCCCAGGGCTCCGTGGTGGCCGGAATATTCTCGACCGACGAGCCCGACTCCATCCACCGGGTCAGCGGGTCTCCCGTGGGCGTCGCCCTCTTTCTCTTCCTCGTCCTCTTCCTCCTCTACAACCGCTTCTCCATCTTCGGCGGCGGTGAGGACGCCGAGTAGCTTTGTCTGGTTTGGTTTTCAAAATCAGTTTT 3 0 3' arm Actinidia_chinensis mirnest 7SK 0.001 100 -92.1 ((....))...((.(((((((.(((((((((....((.((((..((.(((.(((..((((((((((.(((((..((....)).))))).)))))).............))))..)))))).))((((.((((((..((((....(((....)))..))))..))))))(((((........))))).(((((...)))))))))...))))))..))))))))).))))))).)).......... (-92.1)