mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTTCTTCACTGGCAAGCTTT AGCTGCCAGTTGAAGAACTGT CTCCCACACCCTCACCTGGCTGAGCCGCAGTAGTTCTTCACTGGCAAGCTTTATGTCCTGACCCAGCTAAAGCTGCCAGTTGAAGAACTGTTGCCCTCTGCCCCTGGCTTCGTGGAGGA AAGAGACAGAGCGGTCGGCCGTGCGGACAGGTCGCAGTGATTTTGCTCCTCTGTNCACAGCAANCCCCGCACCCAGCATCAGGAACCTGTGCCTCCCACACCCTCACCTGGCTGAGCCGCAGTAGTTCTTCACTGGCAAGCTTTATGTCCTGACCCAGCTAAAGCTGCCAGTTGAAGAACTGTTGCCCTCTGCCCCTGGCTTCGTGGAGGAAGAGGAGAAGCAGCAGCTTTGCCTATCATCCGGAAGGTGACAGAACTGGGGTGGGAAGGTCTGGACAGCTGGGGTGATGGCTTTATGGGAGGGAAACCCTGGTCCTCTGGGGAGCCCTTACCCCCACTGGCCCAGTGAAACATTTAGGTTAAAGGCACTGTCTATAAATTGGGGAATAGGTGACTCCANCTCCCCAAGATTAGTTGAT 0 2 5' arm Mus_musculus mirnest mir-22 3e-39 mmu-mir-22 2e-46 -43.6 .(((..(((.....((.(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((....(((...))).)))))))))))).)))))))))))))).))).)))...))....)))..))) (-43.6)