mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTC GATCATTATGGCAGTTTCATC TGCATGTGCACCAAAAGTAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTCATGATATCCTTCTTTTCTTTTTCTTCTCAATCTCTCCTTTTGAATTTGTTTTCCGAAAAAAATAGATTAAAAATTCTGTATATGTAACTAGGTCTAAATGTGAAGGAATCGACGAGATCATTATGGCAGTTTCATCTGCTATTGGGGAGCACAA TCCACATTCACATAGTTGTTCTTCTTCTAATTGGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTGTTTTTTCTTTCCCTTCTTTCTCTTCAATCTTTCATGAACAGATACCAGTTTTGCGCTTCAATTCCCTTCTTCATTTTCCTTTTCTCTAGTTTTGTGTGTTTGACTGTATATGCAGATCTAGTTATTCCATGCATGTGCACCAAAAGTAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTCATGATATCCTTCTTTTCTTTTTCTTCTCAATCTCTCCTTTTGAATTTGTTTTCCGAAAAAAATAGATTAAAAATTCTGTATATGTAACTAGGTCTAAATGTGAAGGAATCGACGAGATCATTATGGCAGTTTCATCTGCTATTGGGGAGCACAATCAAACCCTAGCTACCTGATCTTGCTTGCATACTTTTTTCTGTTTAAATTGGTGTCCATAATGATTTGCTTATGTGATAAGTTGGTGTTGCCTATGAAAGATGCTCGATAATATGAGGAAAAATTCCAGGGTTTGGTTTGGAATGAAGCTAATGGACATGATCAAGTTCTAGGTAGTAACTGGTGTTCCTTACTCATCATCTCGGTTTATTGGCGGATTCTTGCAAGAATATCGGTTCACATGCTCGATATCAACTCCTCTCCGAGCCTTACAATTTATAATTTTATAAATAGAAACATTCAACAGGGTCATAATCATCCCTCTA 2 0 5' arm Curcuma_longa mirnest MIR167_1 0.0000007 sbi-MIR167d 0.00000004 -59.9 ....(((((.((((.(((((.(((((((((((..((((((((.((((.((((((.........(((..............(((.((((((((((......))))))))))..)))................))).........))))))))))..))))))))..))))))))))).))))).))))...))))). (-59.9)