mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTC GATCATTATGGCAGTTTCATC TGCATGTGCACCAAAAGTAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTCATGATATCCTTCTTTTCTTTTTCTTCTCAATCTCTCCTTTTGAATTTGTTTTCCGAAAAAAATAGATTAAAAATTCTGTATATGTAACTAGGTCTAAATGTGAAGGAATCGACGAGATCATTATGGCAGTTTCATCTGCTATTGGGGAGCACAA TCCACATTCACATAGTTGTTCTTCTTCTAATTGGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTGTTTTTTCTTTCCCTTCTTTCTCTTCAATCTTTCATGAACAGATACCAGTTTTGCGCTTCAATTCCCTTCTTCATTTTCCTTTTCTCTAGTTTTGTGTGTTTGACTGTATATGCAGATCTAGTTATTCCATGCATGTGCACCAAAAGTAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTCATGATATCCTTCTTTTCTTTTTCTTCTCAATCTCTCCTTTTGAATTTGTTTTCCGAAAAAAATAGATTAAAAATTCTGTATATGTAACTAGGTCTAAATGTGAAGGAATCGACGAGATCATTATGGCAGTTTCATCTGCTATTGGGGAGCACAATCAAACCCTAGCTACCTGATCTTGCTTGCATACTTTTTTCTGTTTAAATTGGTGTCCATAATGATTTGCTTATGTGATAAGTTGGTGTTGCCTATGAAAGATGCTCGATAATATGAGGAAAAATTCCAGGGTTTGGTTTGGAATGAAGCTAATGGACATGATCAAGTTCTAGGTAGTAACTGGTGTTCCTTACTCATCATCTCGGTTTATTGGCGGATTCTTGCAAGAATATCGGTTCACATGCTCGATATCAACTCCTCTCCGAGCCTTACAATTTATAATTTTATAAATAGAAACATTCAACAGGGTCATAATCATCCCTCTA 2 0 5' arm Curcuma_longa mirnest MIR167_1 7.0E-7 sbi-MIR167d 4.0E-8 -59.9 ....(((((.((((.(((((.(((((((((((..((((((((.((((.((((((.........(((..............(((.((((((((((......))))))))))..)))................))).........))))))))))..))))))))..))))))))))).))))).))))...))))). (-59.9)