mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGCAGAGTGAGACCCTGTG CAGGGTTTCACTCTGTGGC AGTCAGCTTGTCCTGCAGAGTGAGACCCTGTGTTAGACCAATGGAGGGGTGGGGAGAACATAATCCTGTTACACAGGGTTTCACTCTGTGGCTGCAGCCC CTTTTTCTTGTGCTCTTTGTGCCTACAGTGCTGGAGTTGATTCCACCTTTAGTCTATTCTTTTCGTTTGTGTATCCCTCTTGTTGTAGTTCCATTGATGTGGCATCCTAACTTCTGGAAGAGGAGAGCAGTTGGTTGTTCCTGAAGATCCCTCTCTATTGTTCTTCTGTGGGCCTCATTAATTATGTAAATTAAGCCACTTTCAGGCTCAGAATGTGCCCTGACTCCTTCTGCAGAGCCTGTGTTGGTGACTAATGCCTATAATCCCAGCACTTGGGAGACTGATGCTGGATGGTCGTGAGTTCAAGTCAGCTTGTCCTGCAGAGTGAGACCCTGTGTTAGACCAATGGAGGGGTGGGGAGAACATAATCCTGTTACACAGGGTTTCACTCTGTGGCTGCAGCCCACTGTTA 0 2 5' arm Mus_musculus mirnest 100 100 -42.1 .....((..(((..(((((((((((((((((((..(((....(((...(((.......)))..))).))))))))))))))))))))))))).))..... (-42.1)