mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGATCATCTGGCAGTTTCAAT TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG TGAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCCTTTTCTTTGAAAGATTTTCGCTAAAAAAAAGTCATCTTTAATTCGAGTGTTTCATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTTGTAACTAGTTTTAAGTTTTGCCGCCTTCTCTCCTTCCTTGGTATCTCTATATTAAATCTTCGAAATGAATTCTGCAGAGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAATTTAGTGTTCGTGTTTGCAGGTATCTGTGGAAGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTTAATTATCTAAAAGTCTAATAATGATTGATCAAATAATTAAATTTTCCCTTAAATTCAAGAGAGCGAAGAGGAGTAGGCATACCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTCACCAACAGA CCTTATCACAACCACTGCCATGCATGGCTTCTTTATGCTTCACTATCTACATCACTATTAGCCACATCTCTTCTCTCTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCGTTCTCTTTGGTTCTTATTAAATACATGCTTTTCTCCTCTATTATTTTTCACTCAATTTCTTATCTGCATGATTGAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCCTTTTCTTTGAAAGATTTTCGCTAAAAAAAAGTCATCTTTAATTCGAGTGTTTCATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTTGTAACTAGTTTTAAGTTTTGCCGCCTTCTCTCCTTCCTTGGTATCTCTATATTAAATCTTCGAAATGAATTCTGCAGAGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAATTTAGTGTTCGTGTTTGCAGGTATCTGTGGAAGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTTAATTATCTAAAAGTCTAATAATGATTGATCAAATAATTAAATTTTCCCTTAAATTCAAGAGAGCGAAGAGGAGTAGGCATACCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTCACCAACAGAAGGCGAAAAGTCTGGCAGAATGCCTGCGTGATCAAGAGGAAACTCAAGAAGGTAATAAATGTGTTAATTGCCTCAACTCAAGAAGTCATATTAATTGATTCTTCCTTTTTATGTGCATATCCGTCACGAAATGATGAAAGTTCTAAGTTTTTTTTCCTATCTGTTCTTGGGTGACTAGGCTTATTCTCCTAGATTATTATAAATATCCATTTTGAACATCATACT 1 1 3' arm Curcuma_longa mirnest MIR167_1 1.0E-7 sbi-MIR167c 7.0E-9 -103.6 ....(((((((..(((((((((((((((((((((.((((((((((.(((.((.......(((((((.(((((((((.(((((((.(((((.(((((((......((.((.(((........))).)).))..)))))))..((.((.((((.......)))).)).))..((((.(((......(((((((......(((((...((((.((((((.......(((((..(((..(((((...))))))))...))))).......))))))...)))).))))).)))))))...))))))).))))).)))))))...(((((..(((((((((.....((((.(((((((((.....((((.......))))......))))))))).)))))))).)))))..)))))))))))))))))))))........)).)))...)))))))))))))))))))))))..))))..))))))))))). (-103.6)